早在米克尔·约翰登陆斯坦福桥之前，他就已经非常接近加盟曼联了。 2005年4月29日切尔西 迪马特奥 欧冠冠军切尔西 迪马特奥 欧冠冠军，曼联正式宣布签下米克尔·约翰。转会费为400万英镑；双方签订了为期四年的合同。不过切尔西也宣布他们也与米克尔约翰签约，穆里尼奥甚至带着米克尔约翰参观了蓝军的训练场，表现出了相当的诚意。最终，经过国际足联的介入和法律风波，米克尔·约翰终于加盟了切尔西；但蓝军必须分别向米克尔·约翰的球队林恩和曼联支付400万英镑和1200万英镑；总共以1600万英镑的转会费签下了这名尼日利亚中场。
出道之初，米克尔约翰并没有踢防守型中场，而是踢攻击型中场。当年的世青赛上，米克尔·约翰凭借自己的创造力和气场成为了仅次于球王梅西的赛事银球奖获得者。但在加盟切尔西初期，米克尔约翰被穆里尼奥定位为防守型中场，而不是他在国家队引以为傲的攻击型中场。 “狂人”穆里尼奥看中了身高1.88米、中场级别的米克尔约翰；精湛的护球技术，让他彻底改变了。在马克莱莱和埃辛两位世界级中场球员的带领下，米克尔约翰成长得非常好。
在很多重要比赛中，米克尔约翰都获得了首发机会，比如2008-09赛季的足总杯决赛和2011-12赛季的足总杯决赛。米克尔·约翰是主帅的首选。可见他的重要性是越来越高了。但真正让米克尔约翰成为神的，是他在2012年欧冠决赛中的表现。在慕尼黑的比赛中，切尔西的伤病名单很长。队长兼关键后卫约翰·特里因在对阵巴塞罗那的半决赛中愚蠢地侵犯桑切斯而被禁赛三场；伊万诺维被禁赛三场。齐、拉米雷斯和梅雷莱斯三名中场球员也因累积黄牌而面临停赛。
米克尔约翰那场比赛的表现只能用惊艳来形容。他成为大卫·路易斯和卡希尔面前的可靠屏障，击败了托马斯·穆勒和托尼·克罗斯等拜仁球星。冻结，整场比赛成功最大限度地减少了拜仁的威胁性进攻。最终切尔西得以顺利夺得冠军。除了德罗巴（打进两球）和切赫（扑出多个点球）之外，米克尔约翰的贡献比队长兰帕德还要大。
此后，米克尔约翰在迪马特奥、贝尼特斯、穆里尼奥、希丁克麾下占据了极其重要的位置。尤其是埃辛因膝伤而水平大幅下滑后切尔西 迪马特奥 欧冠冠军，米克尔约翰从他手中接过了主力后腰的位置。
2016年夏天，米克尔·约翰随尼日利亚队参加奥运会并获得铜牌。然而，时任主帅孔蒂对儿子参加奥运会而缺席季前赛感到不满，于是无理地将米克尔约翰藏在冰里；冬窗他被送往中甲，这让尼日利亚人的离开不是什么好事。 。不过，米克尔约翰的低调和专注的比赛确实需要得到认可。他绝不会因为没有机会而大惊小怪；他不会因为战术需要而不满他被调到中场，喊着要离队；无论是替补还是首发，他都会全力以赴。 372场比赛；九个大满贯赛冠军。米克尔·约翰赢得了他在蓝军生涯中所能赢得的所有奖杯。这样一个默默无闻的死忠，确实值得粉丝们更多的掌声。